Discovery Studio 2021(化學(xué)實(shí)驗(yàn)軟件)v16.0.0.400 特別版

2022-06-12發(fā)布者:lisi大?。?/span> 下載:0

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軟件介紹

Discovery Studio 2021是一款功能非常強(qiáng)大的化學(xué)實(shí)驗(yàn)軟件。這款軟件主要的功能就是讓用戶(hù)在編輯化學(xué)教材的時(shí)候能夠擁有更多的模型和圖紙?jiān)O(shè)計(jì)方案,如果您需要分析化學(xué)或者是分析分子模型,就可以通過(guò)這款軟件將您的數(shù)據(jù)可視化,將實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)放到軟件上轉(zhuǎn)換為三維分子模型,這樣您的定義實(shí)驗(yàn)結(jié)果的時(shí)候就更加清晰了。軟件擁有的功能非常多,軟件還允許用戶(hù)無(wú)縫地結(jié)合在現(xiàn)代研究中使用的各種方法來(lái)解決不同的計(jì)算問(wèn)題,需要的歡迎下載使用。

安裝步驟

1在本站下載解壓文件,雙擊DS45Client.exe安裝

2點(diǎn)擊下一步

3選擇安裝目錄

4點(diǎn)擊安裝

5安裝完成

7將破解補(bǔ)丁復(fù)制到軟件安裝路徑

8破解完成

軟件特色

  1. Discovery Studio提供了化學(xué)分析的功能

  2. 支持將化學(xué)分析轉(zhuǎn)換到電腦上操作

  3. 可以在電腦上建立分析實(shí)驗(yàn)的模型

  4. 可以在三維的空間上設(shè)計(jì)分析分子以及蛋白質(zhì)的模型

  5. 軟件具有高度可視化設(shè)計(jì)能力

  6. 支持建立化學(xué)方程式以及實(shí)驗(yàn)報(bào)告

  7. 支持建立分子結(jié)構(gòu)以及生物數(shù)據(jù)報(bào)告

  8. 也可以通過(guò)軟件自己定義分子序列

  9. 具有七個(gè)不同的分析方案

  10. 從基礎(chǔ)繪圖到后期模型實(shí)驗(yàn)分析一應(yīng)俱全

軟件功能

一、基本界面和顯示模塊

  1. Discovery Studio Standalone 可視化界面,是利用軟件進(jìn)行分子設(shè)計(jì)和模擬的基礎(chǔ),支持服務(wù)器-客戶(hù)端安裝在同一臺(tái)機(jī)器上的運(yùn)行模式。與Pipeline Pilot Server結(jié)合在一起,提供化學(xué)/生物學(xué)數(shù)據(jù)顯示、模擬/分析、構(gòu)建三維分子、展示動(dòng)態(tài)變化、三維作圖及許多其它功能

  2. Visualizer Client 是服務(wù)器-客戶(hù)端運(yùn)行模式中、客戶(hù)端的可視化界面,用于訪問(wèn)和使用服務(wù)器端的軟件。必須與服務(wù)器端配置的Pipeline Pilot Server協(xié)同工作,為用戶(hù)提供無(wú)與倫比的數(shù)據(jù)、工作流程和計(jì)算資源共享

二、蛋白質(zhì)模擬模塊

  1. DS MODELER

只要給出未知結(jié)構(gòu)序列與另一個(gè)已知三維結(jié)構(gòu)蛋白的比對(duì),利用工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的快速同源模建方法,便可自動(dòng)并快速產(chǎn)生優(yōu)化的蛋白同源模型。對(duì)于靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)及蛋白家族功能結(jié)構(gòu)分析,MODELER是一個(gè)理想的解決方案。用MODELER還可以模擬蛋白突變,進(jìn)行l(wèi)oop區(qū)模建及基于結(jié)構(gòu)的比對(duì)并構(gòu)建有配體結(jié)合的蛋白結(jié)構(gòu)模型。結(jié)合Sequence Analysis模塊,可以全自動(dòng)完成抗體Loop區(qū)模建。結(jié)合軟件里模擬及以結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的藥物設(shè)計(jì)的功能模塊,用MODELER還可以深入研究蛋白結(jié)構(gòu)及功能的關(guān)系

  1. DS Protein Refine

利用CHARMm對(duì)模建好的蛋白質(zhì)進(jìn)行側(cè)鏈和loop區(qū)的優(yōu)化,提高蛋白質(zhì)模型的準(zhǔn)確性

  1. DS Protein Health

蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)合理性評(píng)價(jià)工具。Protein Health模塊運(yùn)用Profiles 3D方法,通過(guò)將三維結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)環(huán)境與特定氨基酸殘基的優(yōu)先外界環(huán)境相比較,獲得相關(guān)結(jié)構(gòu)性質(zhì)與氨基酸序列信息之間的關(guān)系。通過(guò)Protein Health模塊的分析,用戶(hù)可以方便快速地找到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中不合理的區(qū)域

  1. DS Protein Families

通過(guò)分析某一蛋白家族蛋白序列的保守模式以及在三維結(jié)構(gòu)上的保守殘基的位置,可以在分子水平上更好地了解到蛋白功能機(jī)制。Protein Families的簡(jiǎn)單易用的流程(protocols),也可一步步地引導(dǎo)用戶(hù)進(jìn)行分析,從蛋白家族的序列或者結(jié)構(gòu)比對(duì),到進(jìn)化蹤跡分析。而進(jìn)化蹤跡分析包括用分層聚類(lèi)的方法來(lái)建立蛋白家族系統(tǒng)樹(shù)圖以及把這些得到的功能注釋信息畫(huà)到你的三維結(jié)構(gòu)上去。進(jìn)行序列比對(duì)時(shí),允許根據(jù)需要對(duì)比對(duì)結(jié)果添加約束,提高活性部位關(guān)鍵殘基的比對(duì)效果

  1. DS Sequence Analysis

與功能已知的其它蛋白的序列進(jìn)行比對(duì),是確定某一蛋白生物功能的第一步。用Sequence Analysis也可以讓用戶(hù)通過(guò)通用的BLAST及PSI-BLAST算法來(lái)搜索本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)或者NCBI網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫(kù),確定蛋白序列的同源區(qū)域。結(jié)果在交互的報(bào)告格式里面顯示以方便進(jìn)行進(jìn)一步的分析及在其它模塊里面的使用。使用Blast搜索PDB或PDB_nr95數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí),結(jié)果文件中可以顯示輸出蛋白質(zhì)的SCOP ID, Ligand ID以及X射線分辨率等信息

更新日志

  • 新的數(shù)據(jù)庫(kù)又得到了化學(xué)結(jié)構(gòu)復(fù)制的方案

  • 可以從數(shù)據(jù)庫(kù)上找到分子方程式的變量數(shù)據(jù)

  • 也可以自己將實(shí)驗(yàn)的結(jié)果制作為研究模板

  • 也可以針對(duì)不同類(lèi)型的化學(xué)元素添加

  • 支持使用電解質(zhì)方程插入到模型上

  • 支持對(duì)分析的化學(xué)結(jié)果添加注釋信息

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